石柱是全国乃至全世界最大的黄连生产、加工及出口基地，而且还是我国黄连的科研和教学基地。凡研究黄连的知名专家、学者无一未到过此地，凡与黄连有关的科技成果大多出自于此，凡记载黄连的典籍皆以石柱为主。全县产量常年保持1500吨以上，占全国黄连的60%以上，出口远销南洋、非洲、欧美洲，石柱黄水市场常年出口量500吨以上。石柱县有悠久的黄连生产历史，唐朝作为贡品上贡朝廷为宫廷御用药，皇宫中秘不外传的皇子保健法中，用黄连艾叶水浸泡黄连给婴儿洗澡，给新生婴儿滴喂以除胎毒。
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